为太平军主力的一到六军序，也再度随着陆续回归的编制而变得齐装满员起来。
其中，又有大量经过初步战阵锻炼和考察的附从武装，被收编改造后分别以补充兵员的形式，（老弱伤病）充入了各地的新屯庄，或是（年轻丁壮）异地编遣入二三线的守备团、护场队。
但是最大的投入则是太平八军为首，主力部队的换装和战术强化；比如除了特殊情况的水军和骑兵之外，其他六个军序都要确保六到八成的以上的披甲率，其中至少一半以上的铁甲（鳞甲、锁子甲、圈条甲乃至锻钢护胸）。
此外，因为这些年养殖业和畜牧业的积累，再加上太平军征战中的罗括所得，每年大概可以出栏一万多头可供骑乘用途的大型牲畜，再加上搜购民间散养的部分，确保六个军序实现至少三成的骡马化，三成的步卒骑乘化。
然后是火器上的装备，每个军至少要维持一支独立配属的火器部队（掷弹手/掷弹兵），约占总体军额的十分之一强。于是这样下，各种地方花费和投入就水涨船高上去了。
当然了，因为这些部队大部分都散布在各个地方，相应的换装和编练工作，也只能是按照距离远近和轻重缓急的需要，来编制逐批轮替进行的日程表。
其中最为优先接受编练和换装的序列，既不是大后方驻守的预备/机动部队，也不是正处一线备敌的展占序列；而是定期从前沿轮换下来修整的二线部队。
因此如今作为一名太平军的新补士卒，甫入补充营中第一阶段，就是使用长矛列阵和行军、应敌的基本训练；在这个阶段若有表现不合格的，就会给淘汰回乡里、屯庄、工场去。
然后，再根据其中新卒的具体表现和特长所在，初步选拔出既能阵列而战，也能适应小团体格击缠斗的刀牌手，或又是多种阵列急射、漫射、攒射的弓弩手。
只有这个时候，他们才能称得上是一名合格的太平新卒。而后在这个基础上，又有更多新的进阶和发展方向。
比如善于骑乘者可以编入马队，参加骑乘作战的基本训练；以决定他们究竟是骑上战马成为一名冲锋陷阵的骑兵，还是骑着骡马机动再阵列而战的骑乘步卒。
善于浮水游泳者，一般都会被接受水军的优先条件，以选出其中能够长期适应操船和水面活动的人员，然后再进行水战跳帮、登岸强袭或是武装横渡的基本训练。
又有身材低矮却擅长山地攀越，不畏崎岖的士卒，就会被编入到屈指可数的几个山兵营中，以接受强化障碍翻越的行军和进击训练，借助器械的山地穿梭拉练，乃至是相应山地环境和特殊装备的对抗操演。
而以身腰臂力健长者，则可以申请加入到投火队的训练当中去，学会简单的望风断距手段，以最终成为一名令人敬仰的掷弹手，乃至是正式的掷弹兵、老掷弹兵、掷弹士。
而今他们又多了一个新的选择。那些身手灵活而意志坚定者，将被配发给三眼铳到发火短铳在内新式火器，以获得远异于弓弩的平射杀伤能力。
至于想要成为的样子队（远程投射器械）的成员，则要求更高，除了要有足够的力气和勇气之外，还要有简单数算、识字的底子，才能学会战阵观瞄测绘的手段。
而作为其中进阶的弩炮士和组头、匠师，甚至还要能够掌握简单修理维护的手段，能够就地取材以备战场不时之需。因此，在军中这些区别和分野也被称为“新三阶、老三阶、火器又三阶”，而成为新进士卒们努力奋斗的方向。
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而在渝州西北与泸州交境的合江口，沿着江岸和山壁之间新构筑起来的土木结构军寨
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