帮助银河共和国一方的轮回者虽然还没办法直接证明帕尔帕廷的西斯尊主身份，但已经足够让绝地武士们对帕尔帕廷产生了怀疑。不能先对帕尔帕廷动手，但银河共和国抢先控制了卡米诺人，中止了克隆人大军的制造。
卡米诺人是沙普利超星系团银河中遗传学最先进的种族，它们依靠科技赚钱，从来不管顾客的目的，本来是制造克隆人军队最好的出品方。但被银河共和国控制后，西斯就没办法制造克隆人大军了。
没有了克隆人大军，仅凭西斯暗中潜伏的力量，就算再加上银河共和国的分离主义者，以及为了原力黑暗面力量而投向西斯的杜库伯爵等人的军队，能够为银河共和国带来巨大的麻烦，但是说要取得胜利，帕尔帕廷知道是做不到的。
这个就必须要说说银河共和国的情况了，银河共和国是一个沙普利超星系团诸多文明广泛参予的民主加盟共和国，但在它之前曾经还存在一个旧共和国，那个旧共和国有着强大的军事力量，但是并不像现在这样几乎探索、涵盖了整个银河。
在旧共和国时代，西斯拥有强大的力量，先后产生过西斯帝国和西斯黑暗兄弟会这样的政权组织，并对其他文明，包括旧共和国发起过多次战争。
在最后的鲁桑战役中，西斯被击败，并被认为所有西斯武士都战死了。绝地武士和旧共和国当时决定将旧共和国扩大，让银河中所有的星球都可以加盟，于是新的银河共和国诞生，绝地武士将领导指挥的权力交还给了银河议会，银河议会深刻反省战争的可怕，并因为觉得西斯已被消灭，不再需要战争，所以宣布大裁军，解散了绝大部份共和国的正规军队，只保留了极少部份，并授予绝地武士们执法权。
西斯在暗中利用分离主义份子，银河共和国缚手缚脚，但当西斯的存在被怀疑时，以银河共和国庞大的人力物力就不是那么容易对付了，绝地武士们也有了警惕，暗算一两个办得到，想大规模消灭他们，只能以战争的方式。
帕尔帕廷被怀疑后，也无法再成为银河议会议长，不能窃取克隆人军队为己用。
所以西斯们才会不惜和银河联邦交易，第一，获得克隆人技术，然后自己制造克隆人大军；第二步则是要对付绝地武士们，相比绝地武士们，西斯武士还是显得数量少了，虽然利用科技可以创造出格里弗斯将军那样的赛博格武士，但成本显然太高了，并且并不是每个赛博格都能成为西斯学徒。
那么有没有办法对抗绝地武士们呢，当然有。
当西斯们从银河共和国与银河联邦的那次交锋中获知详情后，意外的知道在另一个银河中存在生体兵器调制技术。
这简直是为西斯对抗绝地武士量身订造的武器，银河联邦在生体兵器调制上还要讲一下公民权利，只能拿克隆人先作调制实验，西斯更不会管这么多，只要能击败绝地武士，两个西斯尊主之外的任何人都是可以随意牺牲的。这也是西斯们把歼星舰技术都不惜拿出来交易的原因，而且，反正沙普利超星系团银河现在是共和国的，就算歼星舰技术泄露给银河联邦，头疼的也是银河共和国。
如果西斯能在与银河共和国的内斗中胜出，成为新的统治者，帕尔帕廷也不怕银河联邦建造出的歼星舰，因为他手上有更强大的武器，日蚀级、执行者级歼星舰，以及死星。
说回西园寺家，生体兵器调制在银河联邦也是军方机密，为了换取更强大的战舰技术，西园寺正树好不容易才说服军方中与他们家关系非常亲密的一位将军，违反军队保密纪律，从某调制研究所带出了库雷格和维摩亚的调制资料。
应该说，基于上面提到的种种原因，双方在一开始时还是有一定诚意进行第二次交易的，但当真的开始交易时，却都觉得自己亏了。
一个认为帝国级歼星舰岂
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